2019年，根据国家司法体制改革，新密市人民检察院撤销原有19个内设机构，设立办公室、政治部两个综合部门，设立第一检察部、第二检察部、第三检察部、第四检察部、第五检察部、综合业务部六个业务部门。

办公室：一、主要负责机关文电、会务、机要、档案、保密、计财装备等办公室日常工作。二、办公室下挂技术科牌子协助司法办案，负责信息技术服务等工作。三、办公室下挂法警大队牌子负责协助司法办案，负责办案安全警务保障。

政治部：主要负责党的建设和检察队伍建设，思想政治工作、组织人事工作、监察、离退休老干部、宣传和表彰奖励、教育培训等工作。

第一检察部：负责除第二检察部承办案件以外刑事案件的审查逮捕、决定逮捕、审查起诉、出庭支持公诉、抗诉，开展相关立案监督、侦查监督、审判监督及相关案件的补充侦查。

第二检察部：负责监察委移送职务犯罪案件、破坏社会主义市场经济秩序犯罪案件的审查逮捕、决定逮捕、审查起诉、出庭支持公诉、抗诉，开展相关立案监督、侦查监督、审判监督及相关案件的补充侦查。

第三检察部：负责对监狱、看守所和社区矫正机构等执法活动的法律监督，对刑事判决、裁定执行、强制医疗执行、羁押和办案期限的监督，羁押必要性审查。办理罪犯又犯罪案件。以及按照刑事诉讼法规定需要由人民检察院直接受理的其他重大犯罪案件的侦查。

第四检察部：负责对人民法院已经发生法律效力，但确有错误的民事、行政判决和裁定，按照审判监督程序进行抗诉或提请抗诉检察建议；对法院的民事行政诉讼活动进行监督；办理公益诉讼案件。

第五检察部：负责受理向本院的控告和申诉、未成年人犯罪和侵害未成年人犯罪案件的审查批捕、审查起诉、出庭支持公诉、抗诉，开展相关立案监督、侦查监督、审判监督以及相关案件的补充侦查，开展未成年人司法保护和预防未成年人犯罪工作。

        综合业务部：对检察机关办理案件的统一受理、流转分配、流程监控、案件信息公开；对办案期限、办案程序、办案质量进行管理、监督、预警，审核需移送的案卷材料，统一负责检察业务统计、分析，提出针对性的对策建议；组织开展案件质量评查。负责本院的法律政策理论研究工作、检委会工作。